Alguna vez escuche este FUD y me causa gracia recordarlo al ver los datos obtenidos de la mesa redonda Scaling MySQL - Up or Out ? durante la MySQL Conference 2008.

Algunos datos : Flickr no tiene DBA, Wikipedia usa en parte Ubuntu Server y todos hacen las veces de DBA, Fotolog anda con Solaris 10, Facebook mantienen 1800 servidores de base de datos por lo que la caida de uno no afecta mucho y Youtube además de Python usa SUSE 9.

MySQL 6.0 : Top Reasons to use Falcon for Online Applications

Para la instalación de DBDesigner 4 sobre Linux :

• Si la instalación es sobre Ubuntu recomiendo el manual de Juan Oliva.
• Siempre fijarse en la versión de los archivo instalados, como es el caso de libsqlmda.so.4.00
• El valor correcto de conexión avanzada es GetDriverFunc=getSQLDriverMySQL, con “y” minúscula
  
• Puedes configurar los valores por defecto de la conexión en el archivo :
  ./home/-usuariolinux-/.DBDesigner4/DBConn_DefaultSettings.ini
• La configuración de conexión debería quedar algo como :
  GetDriverFunc=getSQLDriverMYSQL
  LibraryNameLinux=libsqlmda.so.4.00
  VendorLibLinux=libmysqlclient.so.15

Manual de referencia de MySQL 5.0 en español